Des chercheurs de l'université de Princeton ont mis au point une nouvelle méthode rapide et fiable pour identifier des changements dans les chromosomes qui se produisent quand les cellules deviennent malignes. La technique révèle comment les cellules modifient leur propre code génétique et pourrait déboucher sur des avancées thérapeutiques grâce à de nouveaux traitements personnalisés en fonction des altérations génétiques spécifiques à chaque cancer. Les cellules cancéreuses ont la propriété de neutraliser les gènes qui assurent le contrôle de la prolifération cellulaire. L'une de ces modifications génétiques majeures se produit quand les cellules suppriment ou multiplient d'importants fragments de leurs propres chromosomes. Jusqu'à présent les scientifiques n'avaient aucun moyen de détecter de manière fine ces changements génétiques majeurs. Mais en combinant les ressources de l'informatique et de la biologie,Olga Troyanskaya et son équipe ont inventé une méthode pour analyser rapidement un génome entier (tous les gènes contenus dans une cellule) et repérer de manière très précise les sections de chromosome qui ont été supprimées ou ajoutées par les cellules cancéreuses. « Cela revient à repérer très vite des caractères dans un gros livre écrit dans une langue que vous ne comprenez pas entièrement » souligne Olga Troyanskaya, Professeur en informatique. » Tout ce que vous savez, ce sont quelques règles générales de grammaire de syntaxe » poursuit la chercheuse. L'astuce des chercheurs a consisté à employer des techniques statistiques avancées pour repérer parmi des milliers de gènes les suppressions et les additions, même les plus minimes. Cette nouvelle méthode est le résultat d'une collaboration exemplaire entre biologistes et informaticiens, comme le souligne Olga Troyanskaya. "Pour ce genre de problème vous avez besoin de personnes qui comprennent l'informatique, les statistiques et la biologie et ni les uns, ni les autres, n'auraient pu, seuls, découvrir cette méthode. » Les chercheurs ont appliqué leur technique aux cellules de levure aussi bien qu'aux cellules cancéreuses humaines et ont découvert de nombreuses additions et suppressions précédemment inconnues. Ces résultats suggèrent que ces réplications ou suppressions de chromosomes sont bien plus communes qu'on ne l'imaginait. Cette technique pourrait être particulièrement importante pour la recherche sur le cancer parce qu'elle permettra aux chercheurs de caractériser de manière très précise les tumeurs sur le plan des altérations génétiques et de mettre au point des traitements exactement ciblés en fonction de ces altérations. Cette méthode va également permettre de mieux comprendre au niveau moléculaire comment une cellule normale, sous la pression d'un changement de son environnement, peut se transformer en cellule cancéreuse. Cette application remarquable de l'informatique et des statistiques aux questions de modifications et de régulations génétiques a été saluée par l'ensemble de la communauté scientifique et le journal du MIT vient d'annoncer qu'il avait nominé Olga Troyanskaya dans sa liste annuelle des 100 meilleurs chercheurs du monde. Fort de ce succès, Troyanskaya et ses collègues continuent leur travail sur les altérations chromosomiques en matière de cancer.
Article @RTFlash
SD: http://www.sciencedaily.com/releases/2004/10/041012083840.htm
